莫角山遗址呈长方形，东西长约670米，南北宽450米，面积30余万平方米，土层厚达10.2米。大土台上还有3个小的土墩，呈三足鼎立之势。

南为乌龟山，北名小莫角山，东谓大莫角山。从发掘的1400平方米中发现大片的夯筑基址和大型柱洞遗迹，考古学家推测这里可能是一个中心城址，是良渚文化的政治、经济、文化中心。莫角山遗址的发现对研究良渚文化的聚落形态、社会性质，以及探索中华文明的起源提供了重要的考古资料。